MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acinetobacter baumannii ATCC 17978 plasmid pAB2

Total Repeats: 251

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009084	GA	3	6	3	8	50 %	0 %	50 %	0 %	126640110
2	NC_009084	ACTTAG	2	12	50	61	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	126640110
3	NC_009084	AAC	2	6	65	70	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126640110
4	NC_009084	TTG	2	6	89	94	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126640110
5	NC_009084	ATCA	2	8	160	167	50 %	25 %	0 %	25 %	126640110
6	NC_009084	CG	3	6	228	233	0 %	0 %	50 %	50 %	126640110
7	NC_009084	A	6	6	253	258	100 %	0 %	0 %	0 %	126640110
8	NC_009084	CTG	2	6	350	355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126640110
9	NC_009084	GAA	2	6	379	384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640110
10	NC_009084	TAG	2	6	414	419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126640110
11	NC_009084	TAG	2	6	423	428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126640110
12	NC_009084	AGAA	2	8	511	518	75 %	0 %	25 %	0 %	126640110
13	NC_009084	AAAT	2	8	593	600	75 %	25 %	0 %	0 %	126640110
14	NC_009084	AGA	3	9	680	688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640110
15	NC_009084	T	6	6	731	736	0 %	100 %	0 %	0 %	126640110
16	NC_009084	A	7	7	900	906	100 %	0 %	0 %	0 %	126640110
17	NC_009084	A	6	6	974	979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009084	A	6	6	1104	1109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009084	ATC	2	6	1114	1119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009084	AAG	2	6	1125	1130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009084	TGA	2	6	1132	1137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009084	A	7	7	1144	1150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009084	A	6	6	1178	1183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009084	GAA	2	6	1196	1201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009084	CAA	2	6	1211	1216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009084	CAG	2	6	1266	1271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009084	CAC	2	6	1272	1277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_009084	ACA	2	6	1322	1327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009084	CAA	2	6	1328	1333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009084	AAT	2	6	1352	1357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009084	CACAA	2	10	1458	1467	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_009084	A	6	6	1466	1471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009084	ATT	2	6	1569	1574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009084	GCT	2	6	1583	1588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009084	AAAG	2	8	1634	1641	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009084	AAAAAG	2	12	1657	1668	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009084	ATT	2	6	1682	1687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009084	TGA	2	6	1717	1722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009084	AAT	2	6	1723	1728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009084	A	7	7	1752	1758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009084	TAT	2	6	1843	1848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009084	AAT	2	6	1933	1938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009084	T	6	6	1942	1947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009084	AGAAGT	2	12	1957	1968	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009084	TTA	2	6	2045	2050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009084	TAT	2	6	2089	2094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009084	AATA	2	8	2198	2205	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009084	CCAT	2	8	2220	2227	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009084	ATG	2	6	2311	2316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009084	A	6	6	2452	2457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009084	GCTTT	2	10	2458	2467	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_009084	AGA	3	9	2469	2477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009084	GAA	2	6	2479	2484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009084	CAG	2	6	2583	2588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009084	AAG	2	6	2627	2632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009084	AGC	2	6	2652	2657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009084	ATT	2	6	2713	2718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009084	GAT	2	6	2753	2758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009084	TCA	2	6	2775	2780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009084	T	6	6	2865	2870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009084	TAT	2	6	2887	2892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009084	ATA	2	6	2933	2938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009084	ATC	2	6	2952	2957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009084	A	6	6	3041	3046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009084	AAG	2	6	3211	3216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640111
66	NC_009084	CTAAAG	2	12	3322	3333	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	126640111
67	NC_009084	AGG	2	6	3341	3346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126640111
68	NC_009084	CAA	2	6	3441	3446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126640111
69	NC_009084	TGC	2	6	3449	3454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126640111
70	NC_009084	AT	3	6	3539	3544	50 %	50 %	0 %	0 %	126640111
71	NC_009084	CAT	2	6	3594	3599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126640111
72	NC_009084	GCA	2	6	3657	3662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126640111
73	NC_009084	T	6	6	3810	3815	0 %	100 %	0 %	0 %	126640111
74	NC_009084	AGC	2	6	3839	3844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126640111
75	NC_009084	TAGT	2	8	3871	3878	25 %	50 %	25 %	0 %	126640111
76	NC_009084	GCA	2	6	3948	3953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126640111
77	NC_009084	ATT	2	6	4000	4005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126640111
78	NC_009084	A	7	7	4007	4013	100 %	0 %	0 %	0 %	126640111
79	NC_009084	GCT	2	6	4046	4051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126640111
80	NC_009084	ATC	2	6	4165	4170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126640111
81	NC_009084	AGA	2	6	4307	4312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009084	AT	3	6	4333	4338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009084	AAAT	2	8	4345	4352	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009084	ATG	2	6	4357	4362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126640112
85	NC_009084	TTA	2	6	4372	4377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126640112
86	NC_009084	GCA	2	6	4414	4419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126640112
87	NC_009084	GAA	2	6	4513	4518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640112
88	NC_009084	AAG	2	6	4522	4527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640112
89	NC_009084	TGCA	2	8	4554	4561	25 %	25 %	25 %	25 %	126640112
90	NC_009084	GAT	2	6	4573	4578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126640112
91	NC_009084	TCACAT	2	12	4620	4631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126640112
92	NC_009084	TGG	4	12	4647	4658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126640112
93	NC_009084	TGC	2	6	4728	4733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126640112
94	NC_009084	TCG	2	6	4751	4756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126640112
95	NC_009084	CAT	2	6	4847	4852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126640112
96	NC_009084	AGC	2	6	4857	4862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126640112
97	NC_009084	GCA	2	6	4948	4953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126640112
98	NC_009084	A	6	6	4982	4987	100 %	0 %	0 %	0 %	126640112
99	NC_009084	TCA	2	6	5071	5076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126640112
100	NC_009084	TGG	3	9	5106	5114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126640112
101	NC_009084	AAC	2	6	5202	5207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_009084	GCT	2	6	5217	5222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009084	C	7	7	5238	5244	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
104	NC_009084	TAA	2	6	5305	5310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009084	T	6	6	5362	5367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009084	CTT	2	6	5384	5389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009084	AAT	2	6	5393	5398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009084	ATT	2	6	5449	5454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009084	TA	3	6	5456	5461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009084	T	6	6	5474	5479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009084	AGAC	2	8	5596	5603	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_009084	GAA	2	6	5615	5620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009084	TGG	2	6	5664	5669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009084	TGA	2	6	5683	5688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009084	ATC	2	6	5702	5707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009084	GCAAG	2	10	5720	5729	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_009084	GCTT	2	8	5827	5834	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_009084	TGA	2	6	5852	5857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009084	CAA	2	6	5940	5945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_009084	CTTG	2	8	5973	5980	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_009084	ATGA	2	8	6015	6022	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009084	ATGCT	2	10	6034	6043	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_009084	A	6	6	6053	6058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009084	TCA	2	6	6059	6064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_009084	G	7	7	6108	6114	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009084	TAG	2	6	6136	6141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009084	TTATA	2	10	6162	6171	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009084	GTT	2	6	6189	6194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009084	TAAA	2	8	6201	6208	75 %	25 %	0 %	0 %	126640113
130	NC_009084	TAC	2	6	6277	6282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126640113
131	NC_009084	TGA	2	6	6313	6318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126640113
132	NC_009084	ATTC	2	8	6434	6441	25 %	50 %	0 %	25 %	126640113
133	NC_009084	TAT	2	6	6472	6477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126640113
134	NC_009084	AGGA	2	8	6486	6493	50 %	0 %	50 %	0 %	126640113
135	NC_009084	AAT	2	6	6515	6520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126640113
136	NC_009084	GTG	2	6	6606	6611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126640113
137	NC_009084	CAG	2	6	6756	6761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126640113
138	NC_009084	CTC	2	6	6837	6842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126640113
139	NC_009084	AGA	2	6	6871	6876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640113
140	NC_009084	ATA	2	6	6975	6980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126640113
141	NC_009084	ATG	2	6	7011	7016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126640113
142	NC_009084	A	6	6	7099	7104	100 %	0 %	0 %	0 %	126640113
143	NC_009084	TAT	2	6	7115	7120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126640113
144	NC_009084	ATTA	2	8	7145	7152	50 %	50 %	0 %	0 %	126640113
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251	NC_009084	A	7	7	11288	11294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.